ISTAS plantea sus objetivos de actuación en función de las necesidades del movimiento sindical. Sus tareas toman la forma de proyectos de media y larga duración tanto en salud laboral como en medio ambiente. Para mejor desarrollarlos ha creado equipos especializados para la formación, las publicaciones, el asesoramiento y la investigación así como en algunos temas específicos.
Fruto de esta especialización temática nacen el Centro de referencia de ISTAS de organización del trabajo, dedicado a los riesgos psicosociales, el Centro de referencia de ISTAS de movilidad así como el equipo interdisciplinar del riesgo químico. Para llevar adelante el diálogo y el intercambio de experiencias con sindicalistas y profesionales de la prevención de riesgos se han impulsado los Foros ISTAS de Salud Laboral.